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推古天皇元年（593）に創祀された奈良市内で最古の神社と言われています。正式名称は、率川坐大神御子神社ですが、子守明神（安産、育児の神）とも呼ばれています。
この付近を流れていた（今は暗渠となっている）川の名前が率川です。現在も餅井殿センター街から西に向かって石畳の道や橋の跡が残っています。
御祭神※の媛蹈韛五十鈴姫命（ひめたたらいすずひめのみこと）は初代神武天皇の皇后ですが、皇后様を御祭神とする神社は、全国でも数少ないのだそうです。また、媛蹈韛五十鈴姫は、桜井市にある大神神社（おおみわじんじゃ）の御祭神である大物主大神（おおものぬしのおおかみ）の御子でもあり、率川神社は大神神社の境外摂社となっています。
毎年６月１６日～１８日に行われる三枝祭（さいくさのまつり）は、一般に「ゆり祭り」としても知られる率川神社の例祭です。毎年、この日のために大神神社から三輪山に自生するササユリの花が運ばれます。このほか、１月５日には、境内にある率川阿波神社で初戎祭が行われます。
※御祭神は、媛蹈韛五十鈴姫命のほかに狭井大神（御父神：さいのおおかみ）、玉櫛姫命（御母神：たまくしひめのみこと）で、両親とともに祀られていることから子守明神と呼ばれるようになったそうです。また、境内に率川阿波神社、住吉神社、春日神社があります。